Ninja slachterij. Er wordt niet verteld waarom, maar ninja's moeten dood in Stupid Ninjas. Door met een vinger over een ninja te vegen wordt deze op brute wijze in twee-en gesneden, waarna 1 van de wapens die de ninja bezit doorschiet naar de volgende ninja die al zijn huidige wapens in verschillende richtingen laat schieten.
Het klinkt zo simpel maar de ninja's worden zo neergezet dat sommige levels redelijk wat denkwerk vereisen om ervoor te zorgen dat alle ninja's, evenals gouden werp-sterren voor bonuspunten, te pakken worden genomen. Naarmate het spel vordert kan er meer dan 1 veeg gebruikt worden, iets wat het spel eigenlijk minder vermakelijk maakt. Enkele levels worden te makkelijk en andere ronduit vervelend. Bij bepaalde levels is er bijvoorbeeld 2x een bepaalde hoek nodig die moeilijk te doen is en als de 2de keer dan net er naast is moeten beide over... pijnlijk! Wel zitten er ook levels tussen die alsnog met 1 veeg te doen zijn.
Met 180 levels kan Stupid Ninjas behoorlijk wat tijd in beslag nemen maar het is niet altijd even leuk. Mocht het even helemaal niet meer lukken dan zijn er hints, eerste 3 gratis, meer te koop voor echt geld. Ditzelfde geld voor de gratis editie, waar op advertentie's en Game Center support na geen verschil mee is.